疫苗引起的不良反應主要是變態反應，也稱為過敏反應。它是一種免疫病理損傷過程，多由機體再次接觸相同抗原時發生生理功能紊亂和組織損傷引起。注射狂犬病疫苗引起不良反應的臨床表現有：
◆皮膚蕁麻疹和風團塊、痙攣性腹痛、腹瀉、支氣管哮喘、低血壓等。全身反應為全身不適、頭痛、低熱，體溫升高一般不超過38℃，且在數小時后消退。
◆嚴重反應可出現過敏性休克或累及不同器官的危急癥候群。
◆偶有Ⅲ型血管炎型變態反應發生，系由中等分子量的抗原抗體結合物沉積于全身或局部血管基底膜，激活血小板和炎性細胞，進而導致局部炎性病理改變。2007年中國免疫雜志第3期曾報道1例接種人用狂犬病疫苗發生變應性血管炎病例。
◆2007年中國免疫雜志第6期曾報道1例接種人用狂犬病疫苗出現血小板減少性紫癜的病例。
◆疫苗特別是抗血清可能引起嚴重不良反應，因此，出現過敏反應要及時就醫。進行免疫注射的醫療衛生機構必須具備對過敏反應的救治能力。